MD01G1128400.v1.1
HSP70 Family

protein refolding

Design Primers CRISPR Design

Basic Information

Type: gene
Biological Identity
malus_domestica
Chr01
N/A
Physical Location & Seq
Forward (+)
23988705 .. 23989085
381 bp
Loading structure...
UTR
Exon/CDS
Intron
MD01G1128400.v1.1.491

Sequence Viewer

Length: 381 bp
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Functional Annotation
Gene Ontology
Molecular Function
Biological Process
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KEGG Pathways
Metabolic & Signaling
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Pfam Domains
Protein Families
HSP70

Protein Analysis

127

Amino Acids

14.72

Weight (kDa)

9.32

Isoelectric Point (pI)

38.1

Instability Index
Protein Domains (Pfam)
Domain Name Pfam ID Position E-value Description
HSP70 PF00012 3 - 64 7.3e-21 Hsp70 protein
Hydrophobicity Profile (Kyte-Doolittle)
AI Structure Prediction Report
Calculating structure properties...

Genomic Context

Gene Family Tree

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Orthologous Genes

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Restriction Enzyme Sites

1 / 10
Enzyme Recognition Site Cut Count Positions (bp)
Acc65I GGTACC 1 cut(s) 167
AccB1I GGYRCC 1 cut(s) 167
AccB7I CCANNNNNTGG 1 cut(s) 51
AcuI CTGAAG 1 cut(s) 378
AfaI GTAC 1 cut(s) 169
AfiI CCNNNNNNNGG 1 cut(s) 51
AflII CTTAAG 1 cut(s) 298
AgsI TTSAA 1 cut(s) 341
Alw26I GTCTC 1 cut(s) 313
AoxI GGCC 3 cut(s) 78, 178, 348
ApeKI GCWGC 2 cut(s) 142, 217
Asp718I GGTACC 1 cut(s) 167
AsuHPI GGTGA 1 cut(s) 359
BaeI ACNNNNGTAYC 2 cut(s) 159, 192
BanI GGYRCC 1 cut(s) 167
BbsI GAAGAC 1 cut(s) 366
BbvCI CCTCAGC 1 cut(s) 75
BbvI GCAGC 2 cut(s) 154, 229
BclI TGATCA 1 cut(s) 111
BcoDI GTCTC 1 cut(s) 313
BfmI CTRYAG 1 cut(s) 319
BfrI CTTAAG 1 cut(s) 298
BisI GCNGC 2 cut(s) 143, 218
BlsI GCNGC 2 cut(s) 144, 219
BmiI GGNNCC 1 cut(s) 169
BmsI GCATC 1 cut(s) 51
BpiI GAAGAC 1 cut(s) 366
BpmI CTGGAG 1 cut(s) 86
Bpu10I CCTNAGC 1 cut(s) 75
BsaJI CCNNGG 2 cut(s) 45, 171
Bsc4I CCNNNNNNNGG 1 cut(s) 51
Bse3DI GCAATG 1 cut(s) 221
BseDI CCNNGG 2 cut(s) 45, 171
BseGI GGATG 2 cut(s) 41, 189
BseLI CCNNNNNNNGG 1 cut(s) 51
BseMI GCAATG 1 cut(s) 221
BseMII CTCAG 1 cut(s) 66
BseXI GCAGC 2 cut(s) 154, 229
BshFI GGCC 3 cut(s) 80, 180, 350
BshNI GGYRCC 1 cut(s) 167
BslFI GGGAC 1 cut(s) 104
BslI CCNNNNNNNGG 1 cut(s) 51
BsmAI GTCTC 1 cut(s) 313
BsmFI GGGAC 1 cut(s) 104
BsmI GAATGC 1 cut(s) 109
BsnI GGCC 3 cut(s) 80, 180, 350
Bsp143I GATC 1 cut(s) 111
Bsp19I CCATGG 1 cut(s) 45
BspANI GGCC 3 cut(s) 80, 180, 350
BspCNI CTCAG 1 cut(s) 67
BspLI GGNNCC 1 cut(s) 169
BspT107I GGYRCC 1 cut(s) 167
BspTI CTTAAG 1 cut(s) 298
BsrDI GCAATG 1 cut(s) 221
BssECI CCNNGG 2 cut(s) 45, 171
BssMI GATC 1 cut(s) 111
BssT1I CCWWGG 1 cut(s) 45
Bst4CI ACNGT 5 cut(s) 21, 97, 175, 213, 365
BstAFI CTTAAG 1 cut(s) 298
BstAPI GCANNNNNTGC 1 cut(s) 223
BstDEI CTNAG 2 cut(s) 75, 182
BstDSI CCRYGG 2 cut(s) 45, 171
BstF5I GGATG 2 cut(s) 41, 189
BstKTI GATC 1 cut(s) 114
BstMAI GTCTC 1 cut(s) 313
BstMBI GATC 1 cut(s) 111
BstMWI GCNNNNNNNGC 1 cut(s) 223
BstSFI CTRYAG 1 cut(s) 319
BstV1I GCAGC 2 cut(s) 154, 229
BstV2I GAAGAC 1 cut(s) 366
BsuRI GGCC 3 cut(s) 80, 180, 350
BtgI CCRYGG 2 cut(s) 45, 171
BtsCI GGATG 2 cut(s) 41, 189
BtsI GCAGTG 1 cut(s) 351
BtsIMutI CAGTG 2 cut(s) 132, 351
CseI GACGC 1 cut(s) 134
Csp6I GTAC 1 cut(s) 168
CviAII CATG 1 cut(s) 46
CviJI RGCY 6 cut(s) 80, 90, 152, 180, 220, 350
CviKI_1 RGCY 6 cut(s) 80, 90, 152, 180, 220, 350
CviQI GTAC 1 cut(s) 168
DdeI CTNAG 2 cut(s) 75, 182
DpnI GATC 1 cut(s) 113
DpnII GATC 1 cut(s) 111
Eco130I CCWWGG 1 cut(s) 45
Eco147I AGGCCT 1 cut(s) 80
Eco57I CTGAAG 1 cut(s) 378
EcoT14I CCWWGG 1 cut(s) 45
ErhI CCWWGG 1 cut(s) 45
FaeI CATG 1 cut(s) 49
FaiI YATR 3 cut(s) 47, 257, 373
FaqI GGGAC 1 cut(s) 104
FatI CATG 1 cut(s) 45
FbaI TGATCA 1 cut(s) 111
Fnu4HI GCNGC 2 cut(s) 143, 218
FokI GGATG 2 cut(s) 28, 176
Fsp4HI GCNGC 2 cut(s) 143, 218
GluI GCNGC 2 cut(s) 143, 218
GsuI CTGGAG 1 cut(s) 86
HaeIII GGCC 3 cut(s) 80, 180, 350
HgaI GACGC 1 cut(s) 134
Hin1II CATG 1 cut(s) 49
HinfI GANTC 1 cut(s) 137
HphI GGTGA 1 cut(s) 359
Hpy188III TCNNGA 3 cut(s) 10, 29, 273
HpyAV CCTTC 1 cut(s) 340
HpyCH4III ACNGT 5 cut(s) 21, 97, 175, 213, 365
HpyCH4IV ACGT 1 cut(s) 269
HpyF10VI GCNNNNNNNGC 1 cut(s) 223
HpyF3I CTNAG 2 cut(s) 75, 182
HpySE526I ACGT 1 cut(s) 269
Hsp92II CATG 1 cut(s) 49
KpnI GGTACC 1 cut(s) 171
Ksp22I TGATCA 1 cut(s) 111
Kzo9I GATC 1 cut(s) 111
LpnPI CCDG 6 cut(s) 42, 50, 134, 135, 150, 307
Lsp1109I GCAGC 2 cut(s) 154, 229
LweI GCATC 1 cut(s) 51
MaeII ACGT 1 cut(s) 269
MaeIII GTNAC 1 cut(s) 365
MalI GATC 1 cut(s) 113
MboI GATC 1 cut(s) 111
MboII GAAGA 2 cut(s) 112, 371
MlyI GAGTC 1 cut(s) 131
MnlI CCTC 2 cut(s) 70, 369
MseI TTAA 1 cut(s) 299
MspCI CTTAAG 1 cut(s) 298
Mva1269I GAATGC 1 cut(s) 109
MwoI GCNNNNNNNGC 1 cut(s) 223
NcoI CCATGG 1 cut(s) 45
NdeII GATC 1 cut(s) 111
NlaIII CATG 1 cut(s) 49
NlaIV GGNNCC 1 cut(s) 169
NmeAIII GCCGAG 1 cut(s) 66
NmuCI GTSAC 1 cut(s) 365
PceI AGGCCT 1 cut(s) 80
PctI GAATGC 1 cut(s) 109
PflMI CCANNNNNTGG 1 cut(s) 51
PkrI GCNGC 2 cut(s) 144, 219
PleI GAGTC 1 cut(s) 131
PpsI GAGTC 1 cut(s) 131
PspN4I GGNNCC 1 cut(s) 169
RsaI GTAC 1 cut(s) 169
RsaNI GTAC 1 cut(s) 168
SaqAI TTAA 1 cut(s) 299
SatI GCNGC 2 cut(s) 143, 218
Sau3AI GATC 1 cut(s) 111
SchI GAGTC 1 cut(s) 131
SetI ASST 4 cut(s) 9, 272, 372, 380
SfaNI GCATC 1 cut(s) 51
SfcI CTRYAG 1 cut(s) 319
SmlI CTYRAG 1 cut(s) 298
SmoI CTYRAG 1 cut(s) 298
SseBI AGGCCT 1 cut(s) 80
StuI AGGCCT 1 cut(s) 80
StyI CCWWGG 1 cut(s) 45
TaaI ACNGT 5 cut(s) 21, 97, 175, 213, 365
TaiI ACGT 1 cut(s) 272
Tru1I TTAA 1 cut(s) 299
Tru9I TTAA 1 cut(s) 299
TscAI CASTG 2 cut(s) 139, 358
TseFI GTSAC 1 cut(s) 365
TseI GCWGC 2 cut(s) 142, 217
Tsp45I GTSAC 1 cut(s) 365
TspDTI ATGAA 2 cut(s) 17, 48
TspRI CASTG 2 cut(s) 139, 358
Van91I CCANNNNNTGG 1 cut(s) 51
Vha464I CTTAAG 1 cut(s) 298
Using CommOnly database (standard laboratory enzymes). Scanned on CDS sequence.