Rh2AG426200
HSP70 Family

Belongs to the heat shock protein 70 family

Design Primers CRISPR Design

Basic Information

Type: gene
Biological Identity
rosa_samantha
Chr2A
OG0017789
Physical Location & Seq
Reverse (-)
63351522 .. 63352018
497 bp
Loading structure...
UTR
Exon/CDS
Intron
Rh2AG426200.1

Sequence Viewer

Length: 243 bp
ATGGCGGTGCTAGTGAATATGATAGTGTTCGTCTTCTTCGTGCTCCTCTTCGCTGAATCTTTTGGATCGTGTGTGGATGATGACGTGATTGGTATCCATCTCGGAACCACTTATTCGTCGGTGGCCGTGTACAAGAAGAATGGTCAGGTCGAGATGATACCAAATGATGATGGCAAGTGCTTAATTGGTTGGAGAGGAGGCAAGGAACTTAGCCCCCTTCAACCCAGAGCGTACGGTGTTTGA
Functional Annotation
Gene Ontology
Molecular Function
Biological Process
Cellular Component
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KEGG Pathways
Metabolic & Signaling
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Pfam Domains
Protein Families
HSP70

Protein Analysis

80

Amino Acids

8.73

Weight (kDa)

5.04

Isoelectric Point (pI)

24.0

Instability Index
Protein Domains (Pfam)
No Pfam domains detected for this protein.
Hydrophobicity Profile (Kyte-Doolittle)
AI Structure Prediction Report
Calculating structure properties...

Genomic Context

Gene Family Tree

Species Filter
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Orthologous Genes (Group: OG0017789)

Species Orthologous Gene IDs
rosa_chinensis RchiOBHm_Chr2g0142581
rosa_laevigata RLG00000019972
rosa_multiflora Rmu_co8304105.1_g000001 Rmu_sc0004937.1_g000006
rosa_roxburghii Rroxscaffold_2G00102470
rosa_rugosa Rorug02G0374500
rosa_samantha Rh2AG426100 Rh2AG426200 Rh2BG435800 Rh2CG412700 Rh2DG445600
rosa_wichuraiana Rw2G034930

Restriction Enzyme Sites

1 / 10
Enzyme Recognition Site Cut Count Positions (bp)
AciI CCGC 1 cut(s) 5
AclWI GGATC 1 cut(s) 73
AcoI YGGCCR 1 cut(s) 123
AfaI GTAC 2 cut(s) 131, 233
AgsI TTSAA 1 cut(s) 221
AjiI CACGTC 1 cut(s) 85
Alw21I GWGCWC 1 cut(s) 45
AlwI GGATC 1 cut(s) 73
AoxI GGCC 1 cut(s) 123
BbsI GAAGAC 1 cut(s) 25
Bbv12I GWGCWC 1 cut(s) 45
BccI CCATC 2 cut(s) 105, 164
BceAI ACGGC 1 cut(s) 110
BciVI GTATCC 1 cut(s) 104
BfaI CTAG 1 cut(s) 11
BfuI GTATCC 1 cut(s) 104
BmgBI CACGTC 1 cut(s) 85
BmiI GGNNCC 1 cut(s) 106
BpiI GAAGAC 1 cut(s) 25
BsaBI GATNNNNATC 1 cut(s) 92
Bse8I GATNNNNATC 1 cut(s) 92
BseGI GGATG 1 cut(s) 82
BseJI GATNNNNATC 1 cut(s) 92
BseRI GAGGAG 2 cut(s) 35, 210
BshFI GGCC 1 cut(s) 125
BsiHKAI GWGCWC 1 cut(s) 45
BsiWI CGTACG 1 cut(s) 231
BsnI GGCC 1 cut(s) 125
Bsp1286I GDGCHC 1 cut(s) 45
Bsp1407I TGTACA 1 cut(s) 129
Bsp143I GATC 1 cut(s) 65
BspACI CCGC 1 cut(s) 5
BspANI GGCC 1 cut(s) 125
BspLI GGNNCC 1 cut(s) 106
BspPI GGATC 1 cut(s) 73
BsrGI TGTACA 1 cut(s) 129
BssMI GATC 1 cut(s) 65
Bst4CI ACNGT 1 cut(s) 236
Bst6I CTCTTC 1 cut(s) 53
BstAUI TGTACA 1 cut(s) 129
BstDEI CTNAG 1 cut(s) 209
BstF5I GGATG 1 cut(s) 82
BstKTI GATC 1 cut(s) 68
BstMBI GATC 1 cut(s) 65
BstV2I GAAGAC 1 cut(s) 25
BsuI GTATCC 1 cut(s) 104
BsuRI GGCC 1 cut(s) 125
BtrI CACGTC 1 cut(s) 85
BtsCI GGATG 1 cut(s) 82
Csp6I GTAC 2 cut(s) 130, 232
CviJI RGCY 2 cut(s) 125, 213
CviKI_1 RGCY 2 cut(s) 125, 213
CviQI GTAC 2 cut(s) 130, 232
DdeI CTNAG 1 cut(s) 209
DpnI GATC 1 cut(s) 67
DpnII GATC 1 cut(s) 65
EaeI YGGCCR 1 cut(s) 123
Eam1104I CTCTTC 1 cut(s) 53
EarI CTCTTC 1 cut(s) 53
FaiI YATR 1 cut(s) 20
FokI GGATG 1 cut(s) 89
FspBI CTAG 1 cut(s) 11
HaeIII GGCC 1 cut(s) 125
HinfI GANTC 1 cut(s) 56
Hpy166II GTNNAC 1 cut(s) 130
Hpy188I TCNGA 1 cut(s) 104
Hpy188III TCNNGA 1 cut(s) 151
Hpy8I GTNNAC 1 cut(s) 130
Hpy99I CGWCG 1 cut(s) 121
HpyAV CCTTC 1 cut(s) 227
HpyCH4III ACNGT 1 cut(s) 236
HpyCH4IV ACGT 1 cut(s) 84
HpyF3I CTNAG 1 cut(s) 209
HpySE526I ACGT 1 cut(s) 84
Kzo9I GATC 1 cut(s) 65
LmnI GCTCC 1 cut(s) 48
LpnPI CCDG 2 cut(s) 131, 238
MaeI CTAG 1 cut(s) 11
MaeII ACGT 1 cut(s) 84
MalI GATC 1 cut(s) 67
MboI GATC 1 cut(s) 65
MboII GAAGA 4 cut(s) 25, 28, 40, 148
MhlI GDGCHC 1 cut(s) 45
MluCI AATT 1 cut(s) 183
MmeI TCCRAC 1 cut(s) 170
MnlI CCTC 3 cut(s) 56, 188, 191
MseI TTAA 1 cut(s) 182
NdeII GATC 1 cut(s) 65
NlaIV GGNNCC 1 cut(s) 106
PcsI WCGNNNNNNNCGW 1 cut(s) 36
PfeI GAWTC 1 cut(s) 56
Pfl23II CGTACG 1 cut(s) 231
PspLI CGTACG 1 cut(s) 231
PspN4I GGNNCC 1 cut(s) 106
RsaI GTAC 2 cut(s) 131, 233
RsaNI GTAC 2 cut(s) 130, 232
SaqAI TTAA 1 cut(s) 182
Sau3AI GATC 1 cut(s) 65
SduI GDGCHC 1 cut(s) 45
SetI ASST 2 cut(s) 87, 150
Sse9I AATT 1 cut(s) 183
SsiI CCGC 1 cut(s) 5
SspMI CTAG 1 cut(s) 11
TaaI ACNGT 1 cut(s) 236
TaiI ACGT 1 cut(s) 87
TaqI TCGA 1 cut(s) 150
TasI AATT 1 cut(s) 183
TatI WGTACW 1 cut(s) 129
TfiI GAWTC 1 cut(s) 56
Tru1I TTAA 1 cut(s) 182
Tru9I TTAA 1 cut(s) 182
XspI CTAG 1 cut(s) 11
Using CommOnly database (standard laboratory enzymes). Scanned on CDS sequence.